財團法人國家實驗研究院（簡稱國研院）成立於2003年6月，將原隸屬於行政院國家科學委員會之國家實驗室，改設財團法人，以增加各研究中心運作的彈性與整合的效率。國研院將統合協調各研究中心之運作，以因應一日千里之科技發展及國家未來科技研究之需求。

國研院主管機關為行政院國家科學委員會，設有董、監事會。國研院現設有十個研究中心以及一個籌備處，分別為：國家奈米元件實驗室、國家實驗動物中心、國家地震工程研究中心、國家太空中心、國家高速網路與計算中心、國家晶片系統設計中心、儀器科技研究中心、科技政策研究與資訊中心、台灣海洋科技研究中心，以及國家颱風洪水研究中心籌備處。國家災害防救科技中心之經費亦編列於本院執行。